В применениях связанных с биофотоникой и оптогенетикой в качестве источников света используются светодиоды, способные одновременно обеспечить высокую скорость переключения света и пространственную точность излучения. Кроме того, по сравнению с лазерами, светодиоды обладают множеством преимуществ: они дешевле, менее габаритные, надежнее и ими легче управлять.
Для исследований в живом организме светодиоды с оптоволоконным выходом способны излучать свет на изучаемую клетку, не оказывая влияния на другие клетки расположенные в непосредственной близости. Кроме того, многоволновые светодиоды с оптоволоконным выходом позволяют переключать свет разной длины волны (например, 470 нм и 590 нм) и излучать его в клетку по тому же самому оптоволокну без необходимости в каком-либо механическом движении или физическом переключении между волокнами.